Troms fylkeskommune har ansvar for miljørelatert planlegging og - koordinering. Dette dreier seg blant annet om
- Arealplanlegging
- Klima- og energiplanlegging
- Kystsoneplanlegging
- Vannforvaltning
- Tilskuddsordninger for friluftsliv
Fylkesmannen har ansvaret for tilsyn på enkelte miljøområder.